Νευροφάρμα
Έργο
Έρευνα φαρμακευτικών πρωτοκόλλων με υπολογιστικούς βιοδείκτες που καθορίζουν την εξέλιξη μη γενετικών νευροεκφυλιστικών νόσων.
Σύντομη περιγραφή
Το αντικείμενο του έργου είναι η διερεύνηση της χρήσης υπολογιστικών βιοδεικτών σε πρωτόκολλα φαρμάκων για τη θεραπεία μη γενετικών νευροεκφυλιστικών ασθενειών. Είναι να εντοπίσει τις πιο αποτελεσματικές φαρμακευτικές θεραπείες για νευροεκφυλιστικές ασθένειες και να καθορίσει πώς μπορούν να χρησιμοποιηθούν υπολογιστικοί βιοδείκτες για την παρακολούθηση της εξέλιξης της νόσου, την πρόβλεψη των αποτελεσμάτων της θεραπείας και την παρακολούθηση της ανταπόκρισης στη θεραπεία.
Η μελέτη περιλαμβάνει την ανάλυση μεγάλου όγκου δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων της νευροαπεικόνισης, γενετικών και κλινικών δεδομένων, για τον εντοπισμό σχετικών υπολογιστικών βιοδεικτών που μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την αξιολόγηση της εξέλιξης της νόσου και της ανταπόκρισης στη θεραπεία. Το έργο περιλαμβάνει επίσης την ανάπτυξη νέων υπολογιστικών μοντέλων και αλγορίθμων για την ανάλυση και την ενοποίηση αυτών των πηγών δεδομένων και τον εντοπισμό των πιο κατατοπιστικών βιοδεικτών.
Η έρευνα σχετικά με τη χρήση υπολογιστικών βιοδεικτών για μη γενετικές νευροεκφυλιστικές ασθένειες αποτελεί ένα πολλά υποσχόμενο πεδίο. Οι υπολογιστικοί βιοδείκτες περιλαμβάνουν τη χρήση αλγορίθμων και τεχνικών μηχανικής μάθησης για την ανάλυση διαφόρων μορφών δεδομένων, όπως η απεικόνιση του εγκεφάλου, οι κλινικές αξιολογήσεις και οι βιολογικοί δείκτες, για την παροχή πληροφοριών σχετικά με την εξέλιξη της νόσου και την ανταπόκριση στη θεραπεία.
Ο απώτερος στόχος είναι η βελτίωση των αποτελεσμάτων των ασθενών και η παροχή νέων ελπίδων σε όσους πάσχουν από νευροεκφυλιστικές ασθένειες.
Σκοπός
Σκοπός του έργου είναι η μελέτη φαρμακευτικών πρωτοκόλλων με υπολογιστικούς βιοδείκτες που καθορίζουν την εξέλιξη μη γενετικών νευροεκφυλιστικών νόσων.
Μελέτη υπαρχόντων φαρμάκων και αλληλεπιδράσεων σε νευροεκφυλιστικές ασθένειες
Ο στόχος αυτής της ενότητας εργασίας είναι να αποτυπώσει την υπάρχουσα τεχνολογική στάθμη όσον αφορά στους διαφορετικούς τύπους νευροεκφυλιστικών ασθενειών και στις υπάρχουσες γνωστές αλληλεπιδράσεις και μηχανισμούς με φαρμακευτικές ουσίες. Οι αλληλεπιδράσεις αυτές θα αναλυθούν και θα αποτυπωθούν σε 3 παραδοτέα, με σκοπό τη συνεχή ενημέρωση από την υπάρχουσα βιβλιογραφία.
Η συγκεκριμένη ενότητα εργασίας θα είναι ενεργή καθόλη τη διάρκεια του έργου με σκοπό να δίνει τα αποτελέσματά της στις υπόλοιπες ενότητες εργασίας.
Παραμετροποίηση εξοπλισμού και εκπαίδευση
Ο στόχος της ενότητας εργασίας 2 η παραμετροποίηση του εξοπλισμού στο εργαστήριο Βιοπληροφορικής και ανθρώπινης Ηλεκτροφυσιολογίας και η εκπαίδευση στη χρήση του.
Συλλογή δεδομένων
Ο στόχος της ενότητας εργασίας 3 είναι η συλλογή δεδομένων για την περαιτέρω ανάλυσή τους. Σε αυτό το πλαίσιο θα συνταχθεί πρωτόκολλο συλλογής δεδομένων που θα αποτυπώνει με σαφήνεια την κατηγορία ασθενών από τους οποίους θα συλλεχθεί δείγμα, τα κριτήρια επιλογής και ο απαιτούμενος αριθμός. Μετά τη σύνταξη του πρωτοκόλλου θα ακολουθήσει η συλλογή των δεδομένων σύμφωνα με το πρωτόκολλο. Επιπλέον θα αναζητηθούν δεδομένα από τις βάσεις δεδομένων KEGG, GEO, GWAS, και OMIM.
Εργαστηριακή ανάλυση δειγμάτων
Ο στόχος της ενότητας εργασίας 4 θα είναι η εργαστηριακή ανάλυση των δειγμάτων με χρήση του υπάρχοντος και του νέου εξοπλισμού που θα αγοραστεί. Θα γίνουν πειράματα με σκοπό να ποσοτικοποιηθούν οι συσχετισμού μεταξύ των βιοδεικτών και των διαφορετικών φαρμακευτικών ουσιών. Θα μελετηθούν διαφορετικές συγκεντρώσεις των φαρμακευτικών ουσιών, καθώς και οι αναλογίες μεταξύ τους, για τις διαφορετικές κατηγορίες των νευροεκφυλιστικών ασθενειών. Η ενότητα εργασίας 4 αποτελεί την πιο σημαντική ενότητα του έργου, μιας και τα αποτελέσματα που θα προκύψουν θα μπορούν να χρησιμοποιηθούν από φαρμακευτικές εταιρείες με σκοπό την πιθανή ανάλυση τους για τροποποίηση φαρμακευτικής αγωγής.
Λογισμικό προσομοίωσης
Ο στόχος της ενότητας εργασίας 5 είναι ο σχεδιασμός και η ανάπτυξη λογισμικού προσομοίωσης, που θα εμφανίζει τις αλληλεπιδράσεις και τους μηχανισμούς σε περιβάλλον υπολογιστή, χρησιμοποιώντας σαν είσοδο διαφορετικές συγκεντρώσεις φαρμάκων και αναλογιών καθώς και διαφορετικό τύπο νευροεκφυλιστικής νόσου και βιοδεικτών. Θα χρησιμοποιηθούν πολύπλοκες τεχνικές παλινδρόμησης για την ανάλυση των συσχετισμών φαρμακευτικών ουσιών και βιοδεικτών που θα προκύψουν από την ενότητα εργασίας 4 για να υλοποιηθούν οι αντίστοιχες προσομοιώσεις.
Αξιολόγηση λογισμικού
Ο στόχος της ενότητας εργασίας 6 είναι να δημιουργηθεί ειδική ομάδα η οποία θα χρησιμοποιήσει το λογισμικό της ενότητας εργασίας 5 και θα το αξιολογήσει. θα αξιολογηθεί το λογισμικό από ειδικούς και θα γίνει μελέτη της χρηστικότητας του από φαρμακευτικές εταιρείες.
Ενέργειες διάχυσης και δημοσιότητας
Διοργάνωση δύο επιστημονικών ημερίδων, συμμετοχή σε συνέδρια, δημοσιεύσεις σε διεθνή περιοδικά. Στόχος της δράσης είναι η ενημέρωση για το έργο, η διάχυση των ερευνητικών αποτελεσμάτων. Οι επιμέρους εργασίες που θα εκτελεστούν είναι η Συγγραφή ερευνητικών άρθρων για διεθνή περιοδικά, η Συμμετοχή σε διεθνή συνέδρια και η Διοργάνωση ημερίδων
Το έργο έχει ενταχθεί στο Επιχειρησιακό Πρόγραμμα «Ιόνια Νησιά 2014-2020», στον άξονα προτεραιότητας «Ενίσχυση της περιφερειακής ανταγωνιστικότητας με ανάπτυξη της επιχειρηματικότητας, της καινοτομίας και των ΤΠΕ» με βάση την Απόφαση Ένταξης με αρ. πρωτ. 3107/07.3.2018 και έχει λάβει κωδικό ΟΠΣ (MIS) 5016117. Συγχρηματοδοτείται από την Ευρωπαϊκή Ένωση (Ευρωπαικό Ταμείο Περιφερειακής Ανάπτυξης-ΕΤΠΑ ) και από εθνικούς πόρους μέσω του ΠΔΕ, με κωδικό ενάριθμου έργου 2018EΠ02210000.
