Νευροεξέλιξη​

Έργο

Έρευνα για την ανάπτυξη υπολογιστικών εργαλείων αξιολόγησης της εξέλιξης μη γενετικών Νευροεκφυλιστικών νόσων με χρήση βιοδεικτών»

Στον Άξονα Προτεραιότητας «Ενίσχυση της περιφερειακής ανταγωνιστικότητας με ανάπτυξη της επιχειρηματικότητας, της καινοτομίας και των ΤΠΕ» του Ε.Π. «Ιόνια Νησιά», με κωδικό ΟΠΣ 5016115 

Τα έργo συγχρηματοδοτείται από το Ευρωπαϊκό Ταμείο Περιφερειακής Ανάπτυξης (ΕΤΠΑ), στο πλαίσιο του Επιχειρησιακού Προγράμματος  «Ιόνια Νησιά 2014-2020», ΕΣΠΑ 2014-2020

Σύντομη περιγραφή

Αντικείμενο της πράξης είναι η έρευνα υπαρχόντων υπομοριακών βιοδεικτών για τη χρησιμότητά τους στην αξιολόγηση της εξέλιξης των νευροεκφυλιστικών ασθενειών καθώς και ο εντοπισμός νέων αντίστοιχων μη επεμβατικών υπομοριακών βιοδεικτών. Θα γίνει συλλογή δειγμάτων ασθενών και ανάλυση τους με εξειδικευμένο εξοπλισμό και περαιτέρω ανάλυση τους με πολύπλοκα μοντέλα εξόρυξης γνώσης. Η μελέτη βιοδεικτών στα πλαίσια των νευροεκφυλιστικών ασθενειών δίνει πλέον κατά πολύ ακριβέστερες εκτιμήσεις της εξέλιξης των νόσων σε επίπεδα φυσιολογίας και όχι μακροσκοπικών συμπτωμάτων. Με βάση τα μετρήσιμα αυτά αποτελέσματα μπορούν να διαμορφωθούν νέες αξιολογήσεις για την πορεία εξέλιξης των νόσων οι οποίες εντάσσονται στα πλαίσια της εξατομικευμένης βιο-ιατρικής. Θεωρώντας ως αρχικά δεδομένα μετρήσιμους βιοδείκτες, στόχος της πράξης είναι η ανάπτυξη προγραμμάτων απεικόνισης της εξέλιξης των νόσων ως προς τον χρόνο και την ευστάθεια της ευπάθειας κάθε ατόμου. Η ανάλυση των κλινικών δεδομένων απαιτεί υψηλής πολυπλοκότητας προγραμματισμό και χρήση τεχνικών εξόρυξης δεδομένων, ενώ η επαλήθευσή τους χρειάζεται μεθόδους υπολογισμού και γραμμικοποίησης μη τοπικών μοντέλων. H υπολογιστική αξιολόγηση της εξέλιξης των νόσων μπορεί να οδηγήσει σε εξαγωγή συμπερασμάτων για το βαθμό επικινδυνότητας της εμφάνισής τους σε ατομικό επίπεδο, όσο και σε επίπεδο ομάδων πληθυσμού με κοινά χαρακτηριστικά.

Υποέργο 1ο


Σκοπός του Υποέργου είναι η έρευνα για την ανάπτυξη υπολογιστικών εργαλείων αξιολόγησης της εξέλιξης μη γενετικών Νευροεκφυλιστικών νόσων με χρήση βιοδεικτών

Μελέτη υπαρχόντων βιοδεικτών σε νευροεκφυλιστικές ασθένειες

Ο στόχος αυτής της ενότητας εργασίας είναι να αποτυπώσει την υπάρχουσα τεχνολογική στάθμη όσον αφορά στους διαφορετικούς βιοδείκτες νευροεκφυλιστικών ασθενειών.

Μελέτη υπαρχόντων βιοδεικτών σε νευροεκφυλιστικές ασθένειες

Ο στόχος της ενότητας είναι παραμετροποίηση του εξοπλισμού στο εργαστήριο Βιοπληροφορικής και ανθρώπινης Ηλεκτροφυσιολογίας και η εκπαίδευση στη χρήση του.

Συλλογή δεδομένων

Ο στόχος της ενότητας είναι η συλλογή δεδομένων για την περαιτέρω ανάλυσή τους. Σε αυτό το πλαίσιο θα συνταχθεί πρωτόκολλο συλλογής δεδομένων που θα αποτυπώνει με σαφήνεια την κατηγορία ασθενών από τους οποίους θα συλλεχθεί δείγμα, τα κριτήρια επιλογής και ο απαιτούμενος αριθμός.

Εργαστηριακή ανάλυση δειγμάτων

Ο στόχος αυτής της ενότητας είναι η εργαστηριακή ανάλυση των δειγμάτων με χρήση του υπάρχοντος και του νέου εξοπλισμού που θα αγοραστεί.

Υπολογιστική ανάλυση δεδομένων και ανάπτυξη λογισμικού

Ο στόχος της ενότητας είναι η υπολογιστική ανάλυση των δεδομένων της ενότητας 4 και ο σχεδιασμός και η ανάπτυξη λογισμικού προσομοίωσης, που θα εμφανίζει τις αλληλεπιδράσεις και τους μηχανισμούς σε περιβάλλον υπολογιστή, χρησιμοποιώντας σαν είσοδο διαφορετικούς βιοδείκτες και φαινοτύπους.

Αξιολόγηση λογισμικού

Ο στόχος αυτής της ενότητας είναι η δημιουργία ειδικής ομάδας η οποία θα χρησιμοποιήσει το λογισμικό της ενότητας 5 και θα το αξιολογήσει.

Ενέργειες διάχυσης και δημοσιότητας

Διοργάνωση δύο επιστημονικών ημερίδων, συμμετοχή σε συνέδρια, δημοσιεύσεις σε διεθνή περιοδικά. Στόχος της δράσης είναι η ενημέρωση για το έργο και η διάχυση των ερευνητικών αποτελεσμάτων

Ενότητα εργασίας 1

Π1 Μελέτη βιοδεικτών στις νευροεκφυλιστικές ασθένειες

Ενότητα εργασίας 2

.Π2.1 Παραμετροποίηση εξοπλισμού και εκπαίδευση
 Π2.2 Μικρής έκτασης διαμόρφωση χώρου

Ενότητα εργασίας 3

Π3.1 Πρωτόκολλο συλλογής δεδομένων.
Π3.2 Μελέτη βιοδεικτών στις νευροεκφυλιστικές ασθένειες

Ενότητα εργασίας 4

.Π4.1 Αναφορά συσχετισμών βιοδεικτών με διαφορετικούς φαινοτύπους και διαφορετικά στάδια της εξέλιξης των νευροεκφυλιστικών ασθενειών

Ενότητα εργασίας 5

 Π5.1 Λογισμικό υπολογιστικής ανάλυσης δεδομένων

Ενότητα εργασίας 6

Π6.1 Αποτελέσματα αξιολόγησης λογισμικού

Ενότητα εργασίας 7

Π7.1 Πρακτικά επιστημονικών ημερίδων.
Π7.2 Δημοσιευμένα άρθρα σε περιοδικά και συνέδρια.

Ενότητα εργασίας 1

Π1 Μελέτη βιοδεικτών στις νευροεκφυλιστικές ασθένειες

Ενότητα εργασίας 2

Π2.1 Παραμετροποίηση εξοπλισμού και εκπαίδευση
 Π2.2 Μικρής έκτασης διαμόρφωση χώρου

Ενότητα εργασίας 3

Π3.1 Πρωτόκολλο συλλογής δεδομένων
Π3.2 Μελέτη βιοδεικτών στις νευροεκφυλιστικές ασθένειες

Ενότητα εργασίας 4

Π4.1 Αναφορά συσχετισμών βιοδεικτών με διαφορετικούς φαινοτύπους και διαφορετικά στάδια της εξέλιξης των νευροεκφυλιστικών ασθενειών

Ενότητα εργασίας 5

 Π5.1 Λογισμικό υπολογιστικής ανάλυσης δεδομένων

Ενότητα εργασίας 6

Π6.1 Αποτελέσματα αξιολόγησης λογισμικού

Ενότητα εργασίας 7

Π7.1 Πρακτικά επιστημονικών ημερίδων
Π7.2 Δημοσιευμένα άρθρα σε περιοδικά και συνέδρια

Αποτελέσματα Έργου από Επιστημονικές Δημοσιεύσεις

Skolariki K, Exarchos, Vlamos P. Gene Network Visualization and Functional Enrichment Analysis in Genes Associated with Amyotrophic Lateral Sclerosis. J Neurosci Neurosurg. 2020 Jun;3(2);148
Vrahatis AG, Kotsireas IS, Vlamos P. A Systems Biology Approach for the Identification of Active Molecular Pathways During the Progression of Alzheimer’s Disease. Adv Exp Med Biol. 2020;1194:303-314

Στοιχεία Υλοποίησης του Έργου

Διάρκεια υλοποίησης 04/2018 – 12/2023
Φορέας Υλοποίησης
ΕΙΔΙΚΟΣ ΛΟΓΑΡΙΑΣΜΟΣ ΚΟΝΔΥΛΙΩΝ ΕΡΑΥΝΑΣ ΙΟΝΙΟΥ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟΥ

Το έργο έχει ενταχθεί στο Επιχειρησιακό Πρόγραμμα «Ιόνια Νησιά 2014-2020», στον άξονα προτεραιότητας «Ενίσχυση της περιφερειακής ανταγωνιστικότητας με ανάπτυξη της επιχειρηματικότητας, της καινοτομίας και των ΤΠΕ» με βάση την Απόφαση Ένταξης με αρ. πρωτ. 3107/07.3.2018  και έχει λάβει κωδικό ΟΠΣ (MIS) 5016115. Συγχρηματοδοτείται από την Ευρωπαϊκή Ένωση (Ευρωπαικό Ταμείο Περιφερειακής Ανάπτυξης-ΕΤΠΑ ) και από εθνικούς πόρους μέσω του ΠΔΕ, με κωδικό ενάριθμου έργου 2018EΠ02210000.

Επικοινωνήστε με τον υπεύθυνο έργου

Τηλέφωνο: +30 2661087710
Διεύθυνση Email: exarchos@ionio.gr
Διεύθυνση: Πλατεία Τσιριγώτη 7, Κέρκυρα, 49100
Όνομα
Επίθετο
Διεύθυνση Email
Το μήνυμα σας
Το μήνυμα σας υποβλήθηκε με επιτυχία!
Παρουσιάστηκε κάποιο σφάλμα κατά την υποβολή της φόρμας. Επαληθεύστε ξανά όλα τα πεδία φόρμας.